同学A:哎,数据分析了好久终于有点眉目了,可是这R语言作图实在是令我头秃呀,一串串的代码,搞得我头昏眼花的,心塞塞~
同学B:哈哈哈,不瞒你说,我刚刚发现了一个万能的作图网站,想要的作图类型应有尽有哦,包括火山图、气泡图、弦图、upsetR、圆形聚类图以及棒棒糖图、GO弦图等等,而且它还提供多种文件下载的格式呢!
同学A:真有这么好的网站???!!你咋现在才说呢!快快给我上链接,让我实践实践!
同学B:哈哈哈,别急别急,链接这就给您呈上呢~
微生信-您身边的数据分析、可视化专家:http://www.bioinformatics.com.cn/
简介微生信是一个在线作图工具网站,主要包括本站在线工具、其他在线工具以及其他在线作图等三大模块,简言之,微生信不仅可以输入自己的数据做出令自己满意的图,也可以利用它的在线工具,进行一些数据的处理。今天,我们主要介绍的则是它的在线作图功能。
首先,打开链接出现如下画面,首次使用您需要进行注册,注册信息仅需一个邮箱号即可,划重点——注册以后许多作图类型0微币即可免费使用,14页的作图类型,任君选择呐!
平时我们经常需要制作的富集分析图也可以利用微生信平台进行制作,而且提供多种类型让你进行选择!
1)带颜色梯度的水平条形图
2)富集GOterm BP,CC,MF三合一柱状图
3)富集气泡图
4)GO chord图(GO 弦图)
操作示例
以绘制聚类图,热图为例。
首先,点击聚类图,热图处进入。
第一步,必须输入-绘图数据,此步可详细参考页面右边的数据类型以及示例数据,仿照其形式进行整理后复制黏贴到方框内即可。
第二步,设置参数,可根据自己的作图要求进行设置,包括图像大小、字体大小、图像颜色聚类方法、聚类方向等,都可以按照自己的意愿进行选择。重点:微生信可以点击选择自己喜欢的颜色!!!
第三步,设置好参数之后,将页面滑动到最底,点击提交,等待3-5秒即可出图。若您看到图片后稍有些不满意的地方,还可返回前一页重新设置参数后再次进行提交,重复提交次数无限制!
最后一步,保存图片。
划重点划重点:微生信下载图片的格式包括PDF、PNG以及SVG矢量图,三种格式任您选择,是不是超级无敌贴心!!!之前小编也尝试过其他的在线作图网站,一般都只提供PNG图片下载格式,就很不方便,但是微生信提供了PDF格式,就为后期需要稍加修改的小伙伴们提供了极大的方便哦。PS:部分未提供的,请在生成图片上点击鼠标右键,选择另存为(直接是svg格式文件,文件后缀不用改)。
除此之外,微生信还可以提供其他类型图片,如圆形聚类图如下
有了微生信,麻麻再也不用担心我学R语言学到秃头了,哈哈哈哈!
注:此推文未经许可禁止转载!阅读推荐:生信实操|一个生信素人的上道经验分享-转录组测序(绘图篇)
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